به کارگیری یک سری جدید پرایمرهای دژنره برای جدا سازی هم زمان ناحیه بسیار متغیر v۳-loop از ژنوتیپ های متفاوت hiv-۱

نویسندگان

شهاب فلاحی

shahab falahi گروه ویروس شناسی پزشکی، دانشگاه تربیت مدرس تهران- ایران ص.پ: 331-14115 مهرداد روانشاد

mehrdad ravashad گروه ویروس شناسی پزشکی، دانشگاه تربیت مدرس تهران- ایران ص.پ: 331-14115 عذرا کنارکوهی

azra kenarkoohi گروه ویروس شناسی پزشکی، دانشگاه تربیت مدرس تهران- ایران ص.پ: 331-14115

چکیده

زمینه و هدف: واکنش زنجیره پلیمراز(pcr) رایج ترین تکنیک در عرصه زیست شناسی مولکولی است که برای تکثیر یک توالی اختصاصی اسید نوکلئیک به کار می رود. پرایمرهای دژنره دارای توانایی تکثیر توالی های وابسته اما متفاوت هستند. هدف مطالعه حاضر استفاده از دو جفت پرایمر دژنره در ترکیب با hemi nested pcr برای تشخیص ناحیه v3-loop ژن پوشش طیف وسیعی از ساب تایپ های ویروس hiv-1 است. مواد و روش ها: در مطالعه تجربی حاضر یک جفت پرایمر دژنره طراحی و بهینه سازی گردید و در ترکیب با hemi nested pcr برای تشخیص ناحیه v3-loop ژن env طیف وسیعی از ژنوتیپ های ویروس hiv-1 که دارای تغییرات نوکلئوتیدی بسیار شدید است استفاده گردید. روش طراحی شده، برروی 40 نمونه سرم مثبت hiv، 10 کنترل منفی و ژنوم انسانی و 5 نمونه از هر کدام از ویروس های hbv,hcv,hgv,ttv انجام شد. یافته ها: پس از بهینه سازی، در 35 مورد از 40 نمونه مثبت باند مورد نظر مشاهده شد. در هیچ یک از نمونه های کنترل منفی انسانی و ویروسی هیچ باندی مشاهده نشد. علاوه بر آن در نمونه های مثبت باند غیر اختصاصی تشکیل نشده بود. نتیجه گیری: در این مطالعه علاوه بر pcr متداول، از دو پرایمر دژنره با قابلیت اتصال به نواحی اختصاصی از ژنوم استفاده گردید. در حقیقت محصولات pcr واکنش اول به عنوان dna الگو برای یک جفت پرایمر داخلی مورد هدف قرار می گیرد و منجر به تولید محصولاتی با اندازه های کوچک تر و با حساسیت بالاتر به دلیل دژنره بودن، خواهد بود. بر اساس یافته های مطالعه، روش طراحی شده دارای مزیت هایی شامل تأیید محصولات اولیه و افزایش حساسیت روش تشخیص می باشد.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

بررسی پاسخ وابسته به زمان دیسک های بین مهره ای سالم و دژنره شده ناحیه گردنی با استفاده از مدل پوروویسکوالاستیک و داده های تست تجربی ریلکسیشن

دیسک بین مهره ای در ستون فقرات عامل انعطاف پذیری، انتقال بار و استهلاک انرژی ضربات ناشی از بارگذاری می باشد. گذشت زمان و اعمال بارگذاریهای نامناسب باعث دژنره شدن دیسکهای بین مهره ای می شود. بررسی پارامترهای بیومکانیکی دیسک سالم و دژنره شده برای کشف مکانیزمهای مربوط به دژنره شدن و یافتن راهکارهای درمان از اهمیت بالایی برخوردار است. در تحقیق حاضر دیسک ناحیه گردنی ستون فقرات به همراه دو مهره مجاور...

متن کامل

آنالیزفیلوژنتیک ومدل سازی ویروس در بیمارا ن آلوده ایرانی hiv براساس ناحیه v3-loop

مقدمه: امروزه از روش های مختلف مدل سازی در پزشکی بالینی، در تشخیص بیماری ها و بررسی ویژگی های مولکولی آنها استفاده می شود. در میان روشهای نوین مدلسازی، سیستمهای فازی از جایگاه ویژه ای در زمینه های مختلف علوم برخوردارند. هدف از این مطالعه بکارگیری یک مدل هوشمند ریاضی برای پیش بینی قدرت زنوتیپی ویروس hiv بر اساس تعدادی از ویژگی های ساختاری پپتید حاصل از ناحیه ی v3 loop است. مواد وروش ها: در مطال...

15 صفحه اول

طراحی کنترل کننده فازی جدید جهت استفاده برای کنترل اتوماتیک تولید(AGC) سیستم حرارتی چند ناحیه ای به هم پیوسته

در این مقاله، مسئله کنترل اتوماتیک تولید سیستم حرارتی سه و پنج ناحیه ­ای با نواحی غیر یکسان و توربین هایی با قید نرخ تولید  3%مورد بررسی قرار گرفته و کنترل­کننده بهینه فازی جدیدی جهت استفاده در  پیشنهاد داده شده است. این کنترل­کننده فازی با استفاده از تکنیک تکاملی محاسباتی الگوریتم ژنتیک بهینه شده است. مقایسه رفتار دینامیکی سیستم در حضور کنترل­ کننده پیشنهادی و کنترل­کننده­ های مرسوم، برتری کنت...

متن کامل

مجموعه آزمایشی جدید برای شبیه سازی رفتار قطعات سامانه سوخت رسانی در شرایط دمایی بسیار سرد

موتورهای دیزل به دلیل بازده بزرگ و گشتاور زیاد در سال های اخیر به نسبت موتورهای بنزینی بیشتر مورد توجه قرار گرفته اند. اما مشکلات مربوط به راه اندازی سرد در رفتار سوخت دیزل در دماهای بسیار کم مسائلی هستند که نیاز به بهبود دارند. در این تحقیق یک مجموعه آزمایشی جدید برای سرد کردن سوخت، تعیین دمای ژل شدن و اندازه گیری مشخصه CFPP سوخت و سنجش عملکرد سامانه پرفشار تزریق سوخت در دماهای پایین با استفاد...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
مجله دانشگاه علوم پزشکی اراک

جلد ۱۴، شماره ۴، صفحات ۶۰-۶۸

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023